Aragorn vole au secours de Boromir attaqué par les Orcs, mais il n'arrive que pour le retrouver mourrant et l'entendre confesser qu'il a succombé au pouvoir de l'anneau.
Boromir demande à Aragorn de se porter maintenant au secours de la capitale menacée de Gondor, Minas Tirith et Aragorm promet que la cité ne tombera pas.
Legolas et Gimli arrivent ensuite. Ensemble ils laissent dériver le corps de Boromir sur une barque elfique.
Aux traces laissées, Aragorn comprend que Merry et Pippin ont été fait prisonniers, et que par ailleurs Frodon et Sam ont fui avec une barque, poursuivant seuls le voyage vers la montagne de feu.
Il décide de porter secours aux deux premiers.
Après plusieurs jours de marche forcée, Aragorn, Legolas et Gimli découvent cinq cadavres d'Orcs. Ils trouvent aussi la broche elfique d'un des Hobbits.
Le cinquième jour, ils font la rencontre d'un groupe de 500 cavaliers de Rohan qu'Aragorn interpelle. Les cavaliers encerclent aussitôt les trois marcheurs lances tendues, mais Aragorn calme le jeu. Le chef des cavaliers se présente : il est Eomer, fils d'Eomund, troisième maréchal de Riddermarck, servant de Theoden, le roi de la Marche de Rohan.
Méfiant, il écoute l'histoire de la quête contée par Aragorn et apprend la chute de Gandalf et la mort de Boromir avec tristesse. Il explique à son tour que la région est sous la menace désormais de Saroumane le traître et que sa troupe a massacré un groupe d'Orcs et d'hourouk-ai peu avant. Il laisse deux chevaux aux marcheurs.
Aragorn, Legolas et Gimli gagnent alors les lieux du combat, ne trouvent que cadavres fumants et pensent les Hobbits morts.
Ils campent pour la nuit aux lisières de la forêt de Fangorn, dont ils content les inquiétantes légendes, notamment celles des hommes-arbres, les Ents.
Pendant la nuit, un vieillard étrange leur rend une visite silencieuse et disparaît avec leur chevaux. Ils suspectent Saroumane...
Parallèlement, Merry et Pippin sont prisonniers des Orcs de Sauron et des Ourouk-haï de Saroumane. Les uns et les autres se disputent sur l'objectif de leur mission, et Pippin profitent de leurs bagarres pour laisser choir l'agraffe elfe de son manteau. Il parvient également à couper les liens des ses poignets.
La troupe est prise en chasse par les Rohiddrim, les cavaliers de Rohan et pendant le combat Merry et Pippin s'échappent et trouvent refuge dans la forêt de Fangorn.
Effrayés par la sombre forêt, ils trouvent un allié de taille en la personne de Sylvebarbe, Ent compatissant qui les emporte dans sa demeure, la Salle du Jaillissement, les nourrit et leur fait conter leur histoire.
Merry et Pippin raconte leur voyage . Ils évoquent Hobbitebourg, Gandalf et les Elfes. Sylvebarbe évoque à son tour le déclin des Ents, qui s'endorment doucement et perdent leur autonomie, la perte des Ents-femmes depuis longtemps disparues, et sa haine pour Saroumane, autrefois son ami, qui aujourd'hui est un serviteur du mal.
Décidé à se mêler à la guerre qui s'annonce, Sylvebarbe réunit le conseil de Ents à Derunant. Après de longues délibérations, les Ents décident de s'attaquer à Isengard et se mettent en marche, emportant Merry et Pippin sur leurs épaules.
Au réveil, Aragorn, Gimli et Legolas scrutent le sol autour du charnier des orcs. Ils lisent dans les traces du sol que Merry et Pippin se sont enfuis, avant le massacre, dans la forêt de Fangorn et vont à leur recherche.
Dans la forêt, ils croisent à nouveau un mystérieux vieillard. Prêts à combattre, ils sont désarmés d'un geste et finissent par reconnaître cette-fois Gandalf, revenu sous la forme de Gandalf le Blanc. Il les rassure sur le sort des Hobbits, raconte en terme sybillins comment il a vaincu le Balrog et les convainc de rejoindre la cité d'Edoras et Medusel, le château de Theoden.
A la lisière de Fangorn, Gandalf d'un sifflement, rappelle les deux chevaux perdus, ainsi que le sien, Gripoil, chef des Mearas, seigneur des chevaux, sur lequel il emporte avec lui Gimli.
Parvenus à Meduseld, le château d'or de Theoden, les quatre doivent laisser leurs armes avant d'être reçus, ce qu'ils acceptent à regret. Gandalf conserve son bâton, prétextant de son grand âge !
C'est un roi Theoden vieux et affaibli qui les reçoit, et reproche à Gandalf de ne venir qu'avec de mauvaises nouvelles. Son conseiller, Grima dit Langue-de-Serpent, persifle sur le compte du magicien, mais celui-ci l'assomme d'un coup de foudre et libère ainsi Theoden des ténèbres qui avaient envahi son esprit.
Soutenu par la belle Eowyn, soeur d'Eomer, [dont le regard a croisé celui d'Aragorn] le roi retrouve sa forme et sa prestance : il fait libérer Eomer, qu'il avait emprisonné sur les fourbes conseils de Grima et exile celui-ci.
Puis il envoie son peuple se réfugier dans les montagnes avant de préparer ses troupes à affronter celles de Saroumane à l'Ouest, laissant Edoras sous les ordres d'Eowyn.
Un messager leur apporte sur le chemin de mauvaises nouvelles : les troupes de Saroumane gagnent du terrain. Erkenbrand et ses troupes ont dû se replier vers la forteresse de Helm.
Sur les conseils de Gandalf, les hommes de Theoden prennent alors à leur tour la route du Gouffre de Helm où se tient cette grande forterresse, nommée Fort-le-Cor, bâtie dans un défilé au dessus d'un ruisseau et au bord d'un profond gouffre.
Gandalf promet de revenir rapidement et prend une autre direction, sans plus d'explication.
Sans embûche, la troupe arrive à la forteresse, où les renforts d'Erkenbrand à la tête des cavaliers de l'Ouestfolde ne sont jamais parvenus.
Peu après, l'assaut commencent. Une marée d'Orcs et de Gobelins frappe les hauts murs. Dans la bataille, Gimli et Legolas comptent les points, à celui qui tuera le plus d'Orcs!
Aragorn et Eomer combattent bravement malgré la supériorité numérique de l'armée qui les assiège. Au plus fort du combat, l'ennemi fait exploser l'un des murs, là où perçait le ruisseau, déblayant toute la défense de Rohan.
Le Mur du Gouffre étant perdu, Aragorn et les autres n'ont d'autres choix après un dernier assaut, que de se replier, derrière les murs du Fort.
Là Theoden décide de mener lui-même une ultime contre-attaque au son du cor de Helm quand l'aurore viendra.
La charge de Theoden est victorieuse, d'autant que du haut des montagnes Gandalf accourre, accompagné des cavaliers de l'Ouestfolde menés par Erkenbrand.
L'ennemi est repoussé.
Menée par Gandalf, la troupe de Thoeden prend le lendemain le chemin de l'Isengard, décidé à profiter de son avantage sur Saroumane. En chemin, ils croisent, sans y croire, quelques Ents qui les ignorent.
Après une nuit de campement, ils arrivent à destination et découvrent qu'Orthanc est détruite, ses murs abattus, ses forges éteintes.
Dans les décombres, ils retrouvent Merry et Pippin qui les attendaient, se restaurant au milieu des décombres. Aragorn, Gimli et Legolas restent à leurs côtés, et les Hobbits leur racontent la chute d'Isengard sous les coups des Ents. Comment ceux-ci, après le départ des troupes de Saroumane pour l'Helm, démolirent les murailles de la cité. Comment ils brisèrent le barrage sur l'Isen pour que les eaux déferlent sur la ville. Comment, à la demande de Gandalf, ils laissèrent Grima rejoindre Saroumane, prisonnier de sa tour.
Gandalf, accompagné de Theoden et de sa troupe, se rend au pied d'Orthanc où Saroumane est retranché. Rejetant sans mal les paroles envoûtantes du traître, Gandalf le rejette de l'ordre des mages et brise à distance le bâton du sorcier. De colère, Grima lance d'une fenêtre le Palentir de Saroumane. Pippin s'en saisit mais Gandalf le lui demande et le conserve.
Puis la compagnie retrouve les Ents qui se donne la tâche de maintenir Saroumane prisonnier de sa tour.
La compagnie reprend la route pour le gouffre d'Helm.
La nuit tombée, Pippin, intrigué et curieux, dérobe le Palentir de Gandalf et manque d'être envoûté par le Mal. Gandalf confie la pierre à Aragorn.
Puis un Nazgûl ailé survole le campement et Gandalf enjoint tout le monde de repartir au plus vite pour la forteresse et part au galop immédiatement, emportant Pippin avec lui vers Minas Thiril.
Frodon et Sam tournent en rond dans les montagnes arides d'Emin Muil. Epuisés et désespérés, ils apprécient plus que jamais les cordes et les lambas offerts par les Elfes.
Une nuit, rendus invisibles par leurs manteaux elfiques, les Hobbits surprennent Gollum, qui les suit, attiré par l'aura de l'anneau. Après une courte bagarre, ils le maîtrisent.
Frodon, qui contrairement à Sam à Gollum en pitié, lui demande de les guider vers Mordor et celui-ci promet de le faire sans traîtrise.
Gollum leur fait traverser les Marais des Morts.
Il affecte une servilité dont Sam n'est pas dupe. Pour Frodon, le poids de l'anneau se fait de plus en plus difficile à supporter. Les Nazgûls ailés qui passent au-dessus d'eux, à trois reprises, remplissent leur coeur d'effroi.
Une nuit, Sam surprend un monologue de leur guide, conversation entre sa part sombre, Gollum, et le reste de d'âme hobbit qui est encore en lui, Sméagol. Sam comprend que la créature demeure effectivement dangereux pour Frodon et lui.
Frodon, Sam et Gollum arrivent enfin à la porte des territoires de Sauron, le Morannon, dans l'escarpement de Cirith Gorgor. Elle est gardée par deux hautes tours et de nombreux gardes, et ils ne savent comment entrer sans se faire prendre.
Gollum convainc Frodon de rallier un autre passage présumé plus facile, du côté de Minas Morgul, mais cela leur demandera encore plusieurs jours de marche.
A cause de leur feu de camp, ils sont repérés par quatre hommes dont Faramir, capitaine de Gondor, en guerre contre les alliés de l'ennemi. Frodon et Sam assistent d'aiileurs peu après à un combat opposant les Hommes de Gondor à ceux de Harad et à leur oliphant.
Faramir se fait ensuite connaître comme le frère de Boromir, dont il a appris la mort en rêve. Il interroge Frodon, qui esquive. Car le Hobbit craint, s'il lui révèle qu'il possède l'anneau, qu'il ne cherche à s'en emparer. Faramir les amène à sa cachette, une vaste grotte aménagée sous une cascade d'eau.
Frodon et Sam se restaurent et prennent du repos. Lors d'une conversation avec Faramir, ils trahissent leur secret et révèle la défaillance de Boromir. Mais Faramir résiste à la tentation de l'anneau.
Un matin, Gollum est découvert. Frodon empêche les hommes de Faramir de le tuer d'une flèche, et l'attire à lui pour qu'il soit capturé vivant. Il répond de lui et Faramir l'épargne, mais Gollum s'est senti trahi par Frodon.
Frodon, Sam quittent les Hommes de Gondor et, malgré les conseils de Faramir, suivent Gollum vers le col de Cirith Ungol.
Après plusieurs jours de marche, ils parviennent en vue de la tour noir de Minas Morgul, et n'ont que le temps de se cacher pour en voir sortir une immense armée sombre menée par le Seigneur des Nazgûls. Cette fois, la guerre a commencé.
Prudemment ils se faufilent jusqu'aux escaliers sans fin de Cirith Ungol. Sans le leur dire, Gollum les mène en fait à Torech Ungol, la caverne d'Arachne, araignée monstrueuse avec laquelle il a conclu un marché.
Perdus dans l'antre obscur, les deux Hobbits éclairent leurs pas avec le cristal d'étoile offert par Galadriel. Grâce à lui ils réussissent à faire reculer la bête tapie dans l'ombre.
L'épée de Frodon, Dard, coupe les toiles qui empêchaient le passage, et les Hobbits ressortent de la grotte saufs.
Mais Sam range trop tôt le don de Galadriel, et par derrière, Gollum lui saute dessus, tandis que Arachne en profite pour poursuivre Frodon.
Le temps pour Sam de mettre en fuite Gollum, Frodon est capturé et ligoté. Sam attaque Arachne, la blesse mortellement de son épée elfique et de la lumière du cristal d'étoile. Le monstre bat en retraite.
Frodon, piqué par Arachne, est immobile et sans vie. Le croyant mort, Sam prend l'anneau pour poursuivre la quête seul. Mais il est pris en chasse par des Orcs, et passe l'anneau à son doigt pour devenir invisible.
Surprenant alors les conversations des orques, Sam comprend que Frodon n'est qu'endormi, mais les Orcs l'ont déjà emporté, et Sam se retrouve seul et abattu, au pied de leur tour.